Храм Покрова Пресвятой Богородицы был построен в селении Баксан в конце XIX начале XX вв. местной казачьей общиной. В 1936 году храм был разрушен.

Жилой дом для перестройки под нынешнюю церковь был приобретен на средства прихожан в 1954 году. Спустя почти 60 лет здание сохраняется за церковью – единственным местом в Баксане для проведения христианских служб.

По просьбе прихожан, на реставрацию церкви из муниципального бюджета выделено около ста тысяч рублей. В настоящее время завершен косметический ремонт фасада, во дворе и на подъездных путях проведен ямочный ремонт, уложен асфальт.

Постоянными прихожанами Храма Покрова Пресвятой Богородицы являются 50 жителей Баксана.